במאי 98 הוקם מוזיאון המרציפן בחצר מוזיאון המושבה של כפר תבור. החיבור של מרציפן לכפר תבור הינו טבעי ביותר מאחר וגידולי השקדים (מהם מכינים מרציפן) בכפר תבור והאזור היו תמיד, מימי ראשית המאה הקודמת, שם דבר. המקום הוקם מתוך רעיון לשלב חוויה צבעונית, מתוקה  ומיוחדת לקהל המבקרים המגוון שיגיע למקום בדמות: 

 התערוכה – תערוכת פיסול במרציפן יחידה במינה בישראל אשר עליה אחראית ג'יליאן פלד, אומנית המקום והראשונה בארץ החלה לעסוק באומנות המרציפן בתחילת שנות השמונים ושהביאה עימה ידע נרחב, כישרון מיוחד וניסיון רב.
 סדנאות היצירה – סדנאות יצירה במרציפן לכל גיל ונפש בהם חווים המבקרים בעצמם את חדוות היצירה ונהנים מפרי יצירתם. 
החיבור למקום – חיבור האנשים למקום באמצעות הדרכה והסבר על תולדות האזור והמושבה והגידולים השונים ביניהם שקדים מהם כמובן מייצרים את המרציפן.
 מוצרי המפעל  – היישר מהמפעל למבקר. המבקרים נהנים מחנות המקום בא נמצאים כל מוצרי המפעל, ביניהם רבים אשר נמכרים רק במקום עצמו ומוצרים טובים נוספים מאזור הגליל והצפון כגון שמנים, יינות, דבש, תבליני ארצנו ועוד.

כעבור שלוש שנים בחודש מאי 2001 הוקם בכפר תבור יקב תבור ואיתו מתחם מבקרים חדש ומקסים. עם הקמתו הועבר מוזיאון המרציפן למתחם החדש באותה המתכונת אך בקנה מידה רחב הרבה יותר כשהוא קולט יותר מבקרים ומספק חוויה גדולה יותר וקסומה יותר.

כעבור שלוש שנים נוספות בחודש אוגוסט 2004, הורחב המוזיאון פעם נוספת תוך הוספה של פן נוסף ליצירה לילדים, יצירה בשוקולד. במקביל גדלו החנות והמפעל ונוספו מוצרים רבים למקום.

כעבור שנתיים נוספות, בקיץ 2006, החלו לראשונה להימכר מוצרי מוזיאון המרציפן אל מחוץ לתחומי המקום וזאת באופן מבוקר וקפדני תוך שמירה על איכות המוצר והאותנטיות אשר אפיינה את המקום במהלך כל השנים. וכל זאת שמונה שנים אחרי הקמת המקום.

כיום נמכרים מוצרי מרציפן ומוצרים נוספים המיוצרים במקום בחנויות רבות בארץ, אך מוצרים רבים של המוזיאון נותרו ייחודיים למקום בלבד. המוזיאון הינו חלק עיקרי ממתחם חוות היין בכפר תבור ומוצריו ושמו כבר מוכרים והפכו לשם נרדף למושבה כפר תבור ולהפך. פני המקום קדימה ולמעלה אך תמיד תוך שמירה על האיכות, הביתיות והאותנטיות אשר אפיינו את המקום מיומו הראשון.